Estas células ya tienen interiores complejos, con vías proteicas internas atravesadas por proteínas motoras que mueven la carga dentro de la célula. Existen estructuras (lisosomas y peroxisomas) destinadas a digerir proteínas dentro de la célula y todos los conceptos básicos del metabolismo eucariótico, la replicación del ADN y la producción de ARN. Una característica importante que faltaba era el conjunto de genes utilizados para determinar cuándo las células deberían dividirse y regular los eventos que deben ocurrir para que eso suceda. Esto puede indicar que la división celular se inicia simplemente debido a problemas metabólicos.
¿Cómo pudo pasar esto?
Aproximadamente un tercio de los grupos de genes parecen ser diferentes de los eucariotas y no tienen equivalentes en otros reinos. Algunos de ellos pueden haber estado en el linaje que produjo el último ancestro común de los eucariotas, y otros pueden haber sido producidos antes de que los eucariotas realmente comenzaran a diversificarse y ramificarse.
Como era de esperar, muchos otros genes se originan en Asgard archaea o Alphaproteobacteria, lo que concuerda con el modelo general de nuestros orígenes. Sin embargo, los investigadores también encontraron contribuciones más o menos iguales de otros dos grupos de bacterias: Planctomycetota y Myxococcota. (Todos los grupos bacterianos involucrados eran diversos y relativamente comunes, en marcado contraste con las arqueas de Asgard). Estos resultados se aplicaron a cada una de las tres selecciones de genes diferentes que habían realizado, por lo que es poco probable que sean un artefacto del análisis.
También hubo pequeñas contribuciones de diferentes grupos de bacterias. Sin embargo, las especies del grupo viral que incluye a los virus gigantes contribuyeron más que cualquier otro grupo bacteriano.
Los investigadores también estimaron el momento en que se introdujeron los grupos de genes. Las arqueas de Asgard representan la contribución más antigua, como se esperaba. Sin embargo, hubo un linaje de bacterias que introdujo muchos genes antes de que existieran las mitocondrias y un segundo grupo que hizo importantes contribuciones más tarde. Esto tiene sentido si los eucariotas evolucionaron en lechos microbianos, donde muchas especies vivieron muy juntas durante largos períodos de tiempo y pudieron haber dependido unas de otras para producir ciertos metabolitos.
